Jeho syn Pavel Novotný, který se stal známou postavou české komunální politiky a bulváru, se nedávno ocitl ve vězení. Pavel, bývalý starosta Řeporyjí, byl odsouzen na tři měsíce za výtržnictví a nebezpečné pronásledování. V rozhovoru pro Seznam Zprávy uvedl, že je vlastně rád, že to skončilo takto, protože politickou prohru by nesl hůře. Délku trestu považuje za „trapnou“ a vyjádřil přání zažít něco více dramatického, než co ho čeká ve věznici na Pankráci.
Pavel Novotný by měl věznici opustit 2. října, ale je možné, že bude propuštěn podmínečně i dříve. Tato situace je pro Petra Novotného další zkouškou, kterou musí v životě překonat, ale i přesto se snaží zůstat silný a optimistický.