Pro otce úspěšného podnikatele, který řídil velkou autobusovou dopravní společnost, byla zpráva o jeho sebevraždě šokem a vůbec tomu nevěřil. Stalo se tak v květnu a měl důvodné podezření, že ho někdo zavraždil. Podezříval synova bývalého kamaráda Jiřího Vařila, který mu prý dlouhodobě ztrpčoval život. Právě on byl kdysi majitelem autobusové společnosti a prý stále zasahoval do její činnosti. Zároveň se říkalo, že Jakub byl pouze jeho „bílým koněm“ a nutil ho k nekalým činům. Nějaký čas před sebevraždou se údajně cítil být ohrožen na životě, na což prý upozornil i policii.
Ivan Vyskočil žádal proto policii o vyšetření. Dlouho po tragickém skonu syna ho nechtěl dát pohřbít, neboť vyžadoval provedení soudní pitvy, což se nakonec i stalo. Po tom všem policejní sbor ukončil práci na případu se závěrem, že šlo o sebevraždu, a případ odložili ad acta. Vůči tomu se však Vyskočil ohradil a podal stížnost. Nyní přišel výsledek přezkoumání žádosti, který potvrdil správnost verdiktu policie. „Policejním orgánům nebyly zjištěny žádné skutečnosti, které by zakládaly podezření, že smrt Jakuba Vyskočila byla zaviněna jednáním jiné osoby,“ potvrdil tento závěr pro Seznam okresní prokurátor v Písku Zbyněk Polívka.
