Nový systém financování bere v úvahu různé provozní náklady, které se mohou lišit například u speciálních tříd nebo základních uměleckých škol. Poslanec Zdeněk Kettner z hnutí SPD vyjádřil svůj nesouhlas s tímto přístupem a nechápe, proč je nutné takové kategorizace.
Ministr školství Mikuláš Bek zdůraznil, že systém také podporuje spolupráci mezi obcemi. Pokud se obce dohodnou na zřízení společných ředitelství pro školy, mohou získat bonus ve výši 20 % na daňových výnosech.
