Nicméně, ne všichni byli nadšeni. Kritici na ČSFD vyjádřili své zklamání. Uživatel Mamlas se ptal, proč Miroslav Donutil natáčí takové „hovadiny“. Sfaxia kritizovala herecký výkon Martina Donutila a jeho manželky, zatímco Negativ označil scénář za tragický a děj za předvídatelný, přičemž seriál podle něj nemá šanci uspět v konkurenci jiných kvalitních pořadů.
I přes smíšené reakce se zdá, že „Záhadné případy“ si našly své publikum a vzbudily zájem o další pokračování.
