Zemanovo zdraví je dlouhodobě předmětem spekulací a obav. Během svého druhého volebního období byl několikrát hospitalizován. V roce 2018 trpěl těžkou otravou krve způsobenou infekcí, která mu způsobila amputaci nohy.
Prezidentovo zdraví má obrovský význam pro fungování státu. Pokud by se jeho zdravotní stav zhoršil do té míry, že by nebyl schopen vykonávat své povinnosti, měl by podle Ústavy ČR rezignovat. Pokud by odmítl, mohl by být odvolán Ústavním soudem.